Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPC24Q8NBT2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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