Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms