Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMNTD2Q8IXW0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms