Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHDC7AQ5VTJ3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms