Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PHYHD1Q5SRE7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PHYHD1Q5SRE7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHYHD1Q5SRE7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PHYHD1Q5SRE7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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PHYHD1Q5SRE7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHYHD1Q5SRE7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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