Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIF1AQ16665 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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