Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK7Q16549 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms