Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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