Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NWD1Q149M9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NWD1Q149M9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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