Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIXQ14938 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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