Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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