Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM29Q14134 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM29Q14134 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms