Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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GRIK2Q13002 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIK2Q13002 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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