Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRJQ12913 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms