Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIN2AQ12879 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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