Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NFIAQ12857 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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