Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC18A2Q05940 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms