Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPCQ03188 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms