Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms