Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms