Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CRIP1P50238 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms