Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTPAP49638 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TTPAP49638 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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