Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1P23471 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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