Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF1P21675 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF1P21675 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF1P21675 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms