Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCP1P13796 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LCP1P13796 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCP1P13796 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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