Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODC1P11926 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms