Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms