Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC175P0C221 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms