Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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