Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms