Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GOLGA6L4A6NEF3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms