Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC2LQ9UL33 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC2LQ9UL33 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRAPPC2LQ9UL33 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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