Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU3

GHRL, Appetite-regulating hormone, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHRLQ9UBU3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GHRLQ9UBU3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms