Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZDHHC18Q9NUE0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms