Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms