Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KLHL4Q9C0H6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL4Q9C0H6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL4Q9C0H6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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