Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZYG11BQ9C0D3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms