Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMIM3Q9BZL3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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