Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms