Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms