Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms