Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms