Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8L2Q96SF2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms