Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms