Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms