Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms