Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGO1Q5FBB7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SGO1Q5FBB7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGO1Q5FBB7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGO1Q5FBB7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGO1Q5FBB7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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