Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDRD12Q587J7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDRD12Q587J7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms