Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms