Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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